Το μητρώο των Windows περιέχει ένα κλειδί ρίζας με τον τίτλο HKEY_LOCAL_MACHINE ή HKLM . Το βασικό κλειδί HKLM περιέχει ρυθμίσεις που σχετίζονται με τον τοπικό υπολογιστή. Στα Microsoft Windows XP και προγενέστερα, υπάρχουν τέσσερα κύρια δευτερεύοντα κλειδιά κάτω από το HKLM: SAM, SECURITY, SOFTWARE, SYSTEM . Υπάρχει επίσης ένα πέμπτο δευτερεύον κλειδί, με τον τίτλο HARDWARE, το οποίο δημιουργείται επί τόπου και δεν αποθηκεύεται σε αρχείο μητρώου. Στα Windows Vista και 7, υπάρχει ένα έκτο δευτερεύον κλειδί με τον τίτλο BCD.

Το δευτερεύον κλειδί του ΛΟΓΙΣΜΙΚΟΥ είναι το πιο συχνά προσβάσιμο κλειδί μητρώου, καθώς περιέχει τις ρυθμίσεις για τα Windows και τα προγράμματα λογισμικού που είναι εγκατεστημένα στον υπολογιστή. Όταν εγκαθίσταται ένα πρόγραμμα λογισμικού, γράφονται δεδομένα στο δευτερεύον κλειδί του ΛΟΓΙΣΜΙΚΟΥ για την αποθήκευση των ρυθμίσεων που αφορούν συγκεκριμένες εφαρμογές. Αυτές οι ρυθμίσεις φορτώνονται στη μνήμη του υπολογιστή κάθε φορά που ξεκινά το λειτουργικό σύστημα, έτσι ώστε όταν ένα πρόγραμμα φορτώνεται από το χρήστη, δεν χρειάζεται να ρυθμίσουν ξανά το πρόγραμμα.

Όροι λογισμικού, μητρώο των Windows